Examinando por Autor "Zahr Tajmuch, Marcela (Directora de tesis)"

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    Aislamiento de bacterias biodegradadoras de hidrocarburos desde aguas empetroladas de la bahía de Quintero
    (Universidad de Valparaíso, 2017) Jeria Cortés, Eduardo; Zahr Tajmuch, Marcela (Directora de tesis)
    El petróleo es una importante fuente económica e industrial que presenta un alto grado de toxicidad para el medio ambiente. Diversos estudios se han realizado para poder controlar y eliminar los efectos adversos que produce el petróleo y sus derivados en el ambiente, en especial el uso de microorganismos o productos microbianos., tales como bioestimulación que consiste en establecer las condiciones necesarias para que las bacterias autóctonas se encarguen de la desintoxicación del ambiente, y bioaumentación, que consiste en el ingreso de bacterias nuevas a un ambiente con el fin de eliminar los componentes tóxicos. En este trabajo se realizó una evaluación del potencial de biodegradación de cepas aisladas de muestras de aguas empetroladas provenientes de la bahía de Quintero a través de su capacidad de crecimiento en medios sólidos en presencia de crudos de petróleo y derivados de hidrocarburos alifáticos como el hexadecano y aromáticos como el antraceno y el criseno. Se hizo una caracterización macroscópica y microscópica de las cepas además de su identificación bioquímica y molecular. Se caracterizaron morfológicamente 33 cepas de las cuales 14 cepas presentaron la capacidad de degradar hidrocarburos, equivalentes al 45% del total de cepas aisladas. Solo 5 fueron capaces de degradar los tres derivados utilizados (Hexadecano, antraceno y criseno). Adicionalmente se caracterizaron bioquímicamente las 14 cepas degradadoras de petróleo obteniéndose preliminarmente que corresponden a EMB5: Acromonas hydrophila, EMB7: Pseudomonas luteola, SDM1: Shewanella putrefaciens, SDM6: Cryseobacterium neningosepticum, SDM7: Senotrophomonas maltophila, SDM8: Aeromonas hydrophila, MZN1: Ochrobactrum anthropi, MZN4: Brevundimonas vesicularis, MZN5: Chryseobacterium indologenes, MZN6: Sphingomonas paucimobilis, MZ9: Photobacterium damselae, MZN14: Oligella ureolytica y MZN16: Sphingomonas paucimobilis. Por métodos moleculares se consiguió amplificación exitosa de las cepas SDM6 y MZN14, por lo que es necesario continuar probando con diferentes condiciones de PCR. Adicionalmente es necesario realizar pruebas adicionales, la determinación de las tasas de degradación de cada derivado de hidrocarburos y la determinación de interacciones antagónicas entre las cepas aisladas para su posible uso en biorremediacion.
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    Caracterización bioquímica y molecular de bacterias resistentes a cobre y arsénico aisladas de la zona de Puchuncaví
    (Universidad de Valparaíso, 2013) Donoso Piñol, Pamela; Zahr Tajmuch, Marcela (Directora de tesis)
    Los metales pesados y metaloides como el cobre y el arsénico, se encuentran en su forma natural a bajas concentraciones en el medio ambiente, pero debido a la actividad humana (agrícola, industrial y urbana) estos valores pueden incrementarse, lo cual puede producir efectos dañinos para todos los organismos. El cobre es un elemento esencial a bajas concentraciones y el arsénico es un metaloide no esencial, que en sus formas As(III) y As(V) puede producir efectos adversos. Ambos metales están presentes en la zona de Puchuncaví, región de Valparaíso, siendo el cobre encontrado en muy altas concentraciones, mientras que el arsénico en concentraciones ligeramente altas para estándares de suelo internacionales. Como las bacterias son capaces de sobrevivir en sitios altamente contaminados por medio del uso de genes de resistencia a metales pesados, el objetivo de este trabajo fue caracterizar e identificar bacterias autóctonas, resistentes a cobre y/o arsénico de la zona de Puchuncaví. Para ello se estudiaron catorce cepas provenientes de esta zona, aisladas en estudios anteriores, las cuales fueron caracterizadas morfológicamente por medio del método de tinción Gram y la observación de colonias, encontrándose ocho cepas Gram negativas y seis cepas Gram positivas, tres de ellas Gram variables, todas con diferentes características en sus colonias. Así también fueron caracterizadas bioquímicamente, por medio del kit API 20 NE de Biomérieux y Biolog® GN2/GP2 MicroPlate™, dando como resultados distintos perfiles bioquímicos para cada cepa. Posteriormente por medio de la amplificación del gen 16S rRNA, diez de las catorce cepas fueron identificadas molecularmente, dando como resultado distintos géneros los cuales fueron, Arthrobacter, Pseudomonas, Pedobacter, Stenotrophomonas, Microbacterium; todas conocidos por poseer especies resistentes a metales. Las catorce cepas fueron estudiadas para determinar su resistencia a Cu(II) utilizando el método de concentración mínima inhibitoria (C.M.I); donde se encontraron tres cepas resistentes a cobre 2A4, C4 y D5, con un C.M.I de 250, 275 y 200ppm respectivamente, siendo 2A4 perteneciente al género Arthrobacter conocido por poseer especies resistentes a metales como Arthrobacter oxydans y C4 al género Pedobacter con especies resistentes como Pedobacter saltans. En el caso del arsénico diez de las catorce cepas tuvieron una tolerancia a As(V), con una concentración de 46.69mM, el máximo estudiado en este trabajo, teniendo en cuenta que a 100mM son consideradas bacterias altamente resistentes a arsénico, aunque en estudios conocidos este valor es usualmente superado. Finalmente podemos decir que debidos a sus características morfológicas, bioquímicas e identificación molecular, todas las cepas corresponden a especies distintas aunque algunas comparten el mismo género. Siendo tres de ellas 2A4, C4 y D5 de especial interés para potenciales estudios sobre genes de resistencia a cobre y biorremediación de suelos contaminados.