Exploración vía simulaciones de dinámica molecular del mecanismo de transporte del ion calcio a través del canal Panexina 1
Fecha
2023
Autores
Profesor Guía
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TMG
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Editor
Universidad de Valparaíso
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Facultad
Facultad de Medicina
Departamento o Escuela
Escuela de Medicina
Determinador
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Especie
Nota general
Opta al grado de Magíster en Ciencias Médicas, mención en Biología Celular y Molecular
Resumen
La Panexina 1 (PANX1) es una proteína de membrana que forma canales que permiten el flujo no selectivo de moléculas. Estudios recientes han reportado la estructura tridimensional de este canal lo que abre la oportunidad de explorar sus propiedades de permeación y las moléculas que podrían fluir a través de este canal.
En esta tesis se generaron modelos computacionales y posterior a ellos simulaciones de dinámica molecular para evaluar la termodinámica de permeación del ion Ca2+ a través del canal de PANX1. Exploramos el comportamiento molecular de la proteína ante el paso del ion Ca2+. en condiciones de baja conductancia de iones con los residuos del dominio carboxi terminal (DCT) intactos y en condiciones de alta conductancia, asociada en general a inflamación, con su DCT removido. Se encontró que el ion de Ca2+ no cruza el poro del canal de PANX1 en su configuración completa debido al bloqueo que aportan los anillos de C426 y E414 del DCT. Por otro lado, cuando la PANX1 está clivada, esta sí permite el paso de Ca2+ a través de su poro central.
Descripción
Lugar de Publicación
Valparaíso
Auspiciador
Palabras clave
PANEXINA 1, PANX1, PERMEACION DE CALCIO, MODELOS COMPUTACIONALES, DINAMICAS MOLECULARES