Examinando por Autor "Ardiles Araya, Alvaro"

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    Exploración vía simulaciones de dinámica molecular del mecanismo de transporte del ion calcio a través del canal Panexina 1
    (Universidad de Valparaíso, 2023) Poblete Flores, Gonzalo Ignacio; Ardiles Araya, Alvaro
    La Panexina 1 (PANX1) es una proteína de membrana que forma canales que permiten el flujo no selectivo de moléculas. Estudios recientes han reportado la estructura tridimensional de este canal lo que abre la oportunidad de explorar sus propiedades de permeación y las moléculas que podrían fluir a través de este canal. En esta tesis se generaron modelos computacionales y posterior a ellos simulaciones de dinámica molecular para evaluar la termodinámica de permeación del ion Ca2+ a través del canal de PANX1. Exploramos el comportamiento molecular de la proteína ante el paso del ion Ca2+. en condiciones de baja conductancia de iones con los residuos del dominio carboxi terminal (DCT) intactos y en condiciones de alta conductancia, asociada en general a inflamación, con su DCT removido. Se encontró que el ion de Ca2+ no cruza el poro del canal de PANX1 en su configuración completa debido al bloqueo que aportan los anillos de C426 y E414 del DCT. Por otro lado, cuando la PANX1 está clivada, esta sí permite el paso de Ca2+ a través de su poro central.