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A beta partial least squares regression model: diagnostics and application to mining data
(Universidad de Valparaíso, 2016) Huerta Aguiar, Mauricio; Advisor: Leiva, Víctor; Advisor: Riquelme, Marco
Partial least squares (PLS) regression is a multivariate technique developed to solve the problem of multicollinearity and/or high dimensionality related to explanatory variables in multiple linear regression. PLS regression has been widely applied assuming normality, but this assumption is often violated in different practical problems. Particularly, if the response variable follows an asymmetric distribution or it is bounded into an interval, normality should be discarded. For example, if this response variable is restricted to values between zero and one, a beta distribution is more suitable for PLS modeling than the normal distribution. We consider a beta PLS regression and its diagnostics for modeling the proportion of kaolinite, a clay mineral present in rocks which is measured by infrared spectroscopy with wavelengths. We propose a residual used in the generalized additive models for location scale and shape and the Cook and Mahalanobis distances as diagnostic tools for this model. We illustrate the proposed methodology with real-world mining data. The analyses and results provided in this study based on the beta PLS regression model and its diagnostics may be of interest for the Chilean mining sector and for the world mining industry.
A stacking neuro-fuzzy framework for time series forecasting from distributed data sources : the case of Rainfall-Runoff modeling
(Universidad de Valparaíso, 2021-02) Querales Carrasquel, Marvin; Advisor: Salas, Rodrigo; Co-advisor: Rosas, Harvey
Los modelos Neuro-Difusos han surgido como un enfoque útil para el pronóstico de series de tiempo dada la capacidad de las redes neuronales para optimizar los parámetros en un sistema difuso. Sin embargo, las estructuras de aprendizaje deben considerar que la información se puede obtener de diferentes tipos de instrumentos, diseños experimentales y otros tipos de fuentes. Teniendo en cuenta que la mayoría de los enfoques de Stacking se basan en la tarea de clasificación, el objetivo de este trabajo fue proponer un nuevo modelo Stacking Neuro-Difuso para la tarea de regresión en el pronóstico de series de tiempo. Esta propuesta fue desarrollada tomando como caso de estudio el fenómeno de modelado de Precipitación- Caudal. El modelo propuesto comprende dos módulos: el nuevo método Self-Identification Neuro-Fuzzy Inference model (SINFIM) desarrollado para el pronóstico individual y el Self-Organizing Neuro-Fuzzy Inference System (SONFIS) como herramienta de stacking. Los datos de dos cuencas hidrográficas chilenas (el río Diguillín (Región de Ñuble) y el río Colorado (Región de Maule)) y la escorrentía diaria promedio y la precipitación diaria promedio registrada de dieciocho años fueron recolectados de la Dirección General de Aguas de Chile (DGA). Los resultados experimentales mostraron un buen ajuste en las predicciones individuales de caudal, con estaciones meteorológicas mostrando índices de ajuste y eficiencia superiores al 80 % en el conjunto de validación, pudiendo predecir eficientemente tanto valores altos como bajos de escorrentías. Sin embargo, se obtuvieron mejores resultados con el modelo de Stacking, siendo superior a las predicciones de escorrentía individuales y otros enfoques como el promedio, regresión lineal múltiple (MLP), Red neuronal artificial (ANN) y Sistema de Neuro-Inferencia adaptativa (ANFIS). Por lo tanto, el marco general propuesto representa una alternativa sólida para pronosticar (en el caso de estudio) la escorrentía en una cuenca determinada, ya que obtiene buenos índices de desempeño y el enfoque de fusión puede mejorar la predicción y obtener valores más precisos que los modelos individuales.
Acido shikímico compuesto de partida para la síntesis de quinonas con potencial actividad biológica
(Universidad Técnica Federico Santa María, 2019) Hernández Pino, Santiago; Cuellar Fritis, Mauricio (Director de tesis)
Las quinonas tetracíclicas son compuestos de interés farmacológico por sus capacidades para combatLas quinonas tetracíclicas son compuestos de interés farmacológico por sus capacidades para combatir la proliferación de células tumorales. De hecho, en quimioterapia es común el uso de fármacos que posean este núcleo estructural, como lo son las antraciclinas. No obstante, estas antraciclinas presentan diversos efectos negativos, como por ejemplo cardiotoxicidad. Debido a esto, es que se hace imperativo desarrollar nuevos compuestos que carezcan de daños colaterales para el organismo del paciente sometido a quimioterapia. Las anguciclinonas son compuestos naturales con esqueleto benz[a]antraquinona con un amplio grado sustituciones en su esqueleto tetracíclico, lo que sitúa a este grupo de antibióticos, después de las tetraciclinas y antraciclinas, como la tercera clase de antibióticos que presentan un esqueleto carbotetracíclico. Se sintetizaron diez nuevos 6-aza-análogos de anguciclinona empleando el (-)-ácido shikímico como compuesto de partida. La actividad citotóxica de estos compuestos fue medida in vitro en tres líneas tumorales; cáncer de próstata (PC-3), cáncer de colon (HT- 29), y cáncer de mama (MCF-7). El compuesto más potente presentó una actividad de IC50 = 0,01 μM contra la línea MCF-7. Con los valores de actividad citotóxica se logró desarrollar un modelo 2D-QSAR para la línea MCF-7, y uno 3D-QSAR/CoMFA para la línea PC-3; ambos modelos cumplen con exhaustivos criterios de validación. Adicionalmente se sintetizó una serie de ocho análogos de aminonaftoquinona; dos de los cuales se sintetizaron a partir del (-)-ácido shikímico, mientras que los seis restantes fueron sintetizado a partir de aminas comerciales. Se midió la actividad citotóxica de estos compuestos; el más potente presentó un valor de IC50 = 1,1 μM contra la línea HT-29. Al comparar la citotoxicidad de la serie de 6-aza-anguciclinonas con la serie de aminonaftoquinonas, se concluye que la estructura tetracíclica de las 6-aza-anguciclinonas otorga a estos compuestos una mayor selectividad por las células tumorales, junto con una mayor potencia. ir la proliferación de células tumorales. De hecho, en quimioterapia es común el uso de fármacos que posean este núcleo estructural, como lo son las antraciclinas. No obstante, estas antraciclinas presentan diversos efectos negativos, como por ejemplo cardiotoxicidad. Debido a esto, es que se hace imperativo desarrollar nuevos compuestos que carezcan de daños colaterales para el organismo del paciente sometido a quimioterapia. Las anguciclinonas son compuestos naturales con esqueleto benz[a]antraquinona con un amplio grado sustituciones en su esqueleto tetracíclico, lo que sitúa a este grupo de antibióticos, después de las tetraciclinas y antraciclinas, como la tercera clase de antibióticos que presentan un esqueleto carbotetracíclico. Se sintetizaron diez nuevos 6-aza-análogos de anguciclinona empleando el (-)-ácido shikímico como compuesto de partida. La actividad citotóxica de estos compuestos fue medida in vitro en tres líneas tumorales; cáncer de próstata (PC-3), cáncer de colon (HT- 29), y cáncer de mama (MCF-7). El compuesto más potente presentó una actividad de IC50 = 0,01 μM contra la línea MCF-7. Con los valores de actividad citotóxica se logró desarrollar un modelo 2D-QSAR para la línea MCF-7, y uno 3D-QSAR/CoMFA para la línea PC-3; ambos modelos cumplen con exhaustivos criterios de validación. Adicionalmente se sintetizó una serie de ocho análogos de aminonaftoquinona; dos de los cuales se sintetizaron a partir del (-)-ácido shikímico, mientras que los seis restantes fueron sintetizado a partir de aminas comerciales. Se midió la actividad citotóxica de estos compuestos; el más potente presentó un valor de IC50 = 1,1 μM contra la línea HT-29. Al comparar la citotoxicidad de la serie de 6-aza-anguciclinonas con la serie de aminonaftoquinonas, se concluye que la estructura tetracíclica de las 6-aza-anguciclinonas otorga a estos compuestos una mayor selectividad por las células tumorales, junto con una mayor potencia.
Acoplamiento funcional entre el canal Hᵥ1 y el complejo enzimático NADPH oxidasa 2 en células supresoras de origen mieloide de Mus musculus
(Universidad de Valparaíso, 2020) Alvear Arias, Juan; González León, Carlos (Director de tesis); Latorre De La Cruz, Ramón (Director de tesis)
Las células supresoras de origen mieloide (MDSC) constituyen una población heterogénea de células la cual tiene la capacidad de inhibir la actividad de los linfocitos T en contextos de inflamación, infección y microambiente tumoral. Uno de los mecanismos por el cual las MDSC ejercen su actividad inmunosupresora es a través de la producción de especies reactivas de oxígeno y nitrógeno por el complejo enzimático NADPH oxidasa 2. Se ha demostrado que, para que este complejo pueda producir especies reactivas de manera sostenida, debe existir una retroalimentación positiva entre la actividad de la enzima y la del canal Hv1. La relación entre la enzima NOX2 y Hv1 ha sido demostrada para células del sistema inmune con actividad proinflamatoria, la cual sustenta la formación de radical superóxido (O2-) durante la fagocitosis, pero no para células con actividad antiinflamatoria como MSDC. El canal Hv1 es una proteína de membrana que posee propiedades biofísicas únicas. Las corrientes de este canal son sensibles tanto al voltaje como al gradiente de pH que se establece a través de la membrana. Hv1 conduce H+ de manera selectiva y su conductancia unitaria se ha estimado dentro del orden de los fS. Además, las corrientes del canal Hv1 son fuertemente inhibidas por Zn+2 y derivados de GBI. Estas propiedades biofísicas lo convierten en la entidad molecular clave para mantener de manera sostenida la función del complejo NOX2. A través de este trabajo, se reporta la expresión funcional del canal Hv1, mediante técnicas de inmunodetección y su caracterización biofísica de las corrientes usando de la técnica de patch-clamp. Además, con la técnica de citometría de flujo, se demostró que el canal Hv1 se expresa en MDSC de ratón, se encuentra acoplado funcionalmente a la actividad del complejo enzimático NOX2 y que dicha interacción se encuentra involucrada en la actividad inmunosupresora de estas células. Este estudio, ofrece evidencias para considerar al canal Hv1 como nuevo e interesante blanco de estudio en terapias contra el cáncer.
Actividad oscilatoria de la corteza prefrontal medial y su relación con la conducta social en un modelo murino de esquizofrenia
(Universidad de Valparaíso, 2024) Cáceres Álvarez, Alex; Negrón, Ignacio (Director de tesis)
El déficit en la conducta social asociado a la esquizofrenia (EZ) se ha vinculado a posibles alteraciones en la maduración neuronal de la corteza prefrontal medial (CPFm) durante la adolescencia. Se postula que la hipofunción de los receptores NMDAR en la CPFm durante este periodo contribuye a desequilibrar la función excitatoria/inhibitoria, afectando las oscilaciones gamma. Aunque se han observado anomalías en estas oscilaciones en individuos con EZ, aún no se ha establecido una conexión clara entre estas alteraciones y la conducta social. Esta investigación busca explorar la hipótesis de que el bloqueo crónico de los receptores NMDAR durante la adolescencia induce un deterioro en la conducta social en ratones adultos, asociado a cambios en los patrones de actividad oscilatoria en la CPFm. OBJETIVO: Corroborar una relación entre los patrones de actividad oscilatoria gamma en la corteza prefrontal medial (CPFm) y la conducta social en la etapa post‐adolescencia en un modelo de esquizofrenia (EZ) inducido mediante el bloqueo crónico de los receptores NMDA durante la adolescencia." MÉTODOS: Se analizó la actividad oscilatoria post adolescencia, mediante registro de potencial de campo local (LFP) en la CPFm durante una prueba de preferencia y novedad social en un grupo control y un grupo murino de EZ generado a partir de la administración crónica con ketamina durante la adolescencia en ratones C57BL/6. RESULTADOS: Nuestros resultados muestran que la administración del antagonista de NMDAR durante la etapa juvenil en ratones C57BL/6 afectó el comportamiento de enfoque de preferencia social post adolescencia, generando mayores tiempos de exploración social con un conespecífico y paralelamente un mayor poder espectral en la actividad oscilatoria en frecuencia gamma en la corteza prefrontal comparado al grupo control. CONCLUSIÓN: Aunque investigaciones anteriores han señalado déficits en la interacción social con el uso de antagonistas NMDAR, el incremento en el enfoque social observado en los ratones tratados con ketamina en nuestro estudio podría indicar un déficit en el reconocimiento social. Por otro lado, estos hallazgos respaldan la hipótesis de que la disfunción de los receptores NMDA desempeña un papel en la alteración de las oscilaciones gamma en la esquizofrenia.
Activity-dependent regulation of the gabaergic synapse
(Universidad de Valparaíso, 2021) González Palma, Daniel; Chiu, Chiayu (Thesis Director)
ABSTRACT: Excitatory and inhibitory balance play a fundamental role in regulation and maintenance of cerebral activity. Inhibitory regulation occurs by the action of diverse GABAergic cells that show activity-dependent changes. Here, we focus on plasticity of inhibitory synapses mediated by somatostatin-expressing interneurons (SOM-INs) and parvalbumin-expressing interneurons (PV-INs). On pyramidal cells, SOM-INs make distal dendritic synapses, while PV-INs make perisomatic synapses. We first discuss the properties of these interneurons and the circuits in which they are embedded to set the theoretical background of this thesis work. Then, we reviewed the diverse forms of inhibitory synaptic plasticity in the literature that mostly disregards the contribution of specific interneuron types. Lastly, through various means of triggering synaptic activity in brain slices, including NMDA application, electrical stimulation and optogenetic activation, in this study, we aim to experimentally compare and contrast the inducibility of plasticity of these two major types of GABAergic synapses on pyramidal cells. In our hands, NMDA activation potentiates inhibition mediated by SOMINs (138.48% increase), while leaving PV-IN synapses unchanged, suggesting that NMDAR activation preferentially modifies distinct types of inhibitory synapses. Our evidence suggests that this plasticity involves postsynaptic changes. While on average, neither electrical nor optogenetic afferent stimulation induced plasticity in both synapses studied, further analysis of individual experiments suggest multiple forms of plasticity were induced. Of note, PV-IN synapses showed a greater predisposition to plasticity than those formed by SOM-INs (90.9% vs 60%). In both synapse types, long-term depression was most frequently observed but with apparently different expression mechanisms. Thus, through discussion of existing literature and experimental studies, we propose that GABAergic synapses are molecularly diverse and follow specific plasticity rules that is linked to the identity of the presynaptic interneuron.
The acute effects of inhibitory kinesio taping on sensorimotor integration at the shoulder girdle in healthy subjects
(Universidad de Valparaíso, 2023) Figueroa Cortés, Raúl; Chiu, Chiayu (Directora de tesis)
Objective: To investigate the acute effects of inhibitory Kinesio taping (iKT) on shoulder proprioception, activity of scapular stabilizer muscles, and scapular kinematics in healthy young adults. Methods: A quasi-experimental repeated measures study was conducted. Twenty-two healthy volunteers were recruited. Surface electromyography and an optical motion capture system were synchronized to record the activity of scapular stabilizer muscles and scapulohumeral kinematics during shoulder proprioceptive tasks without visual feedback. Volunteers were treated with Kinesio taping applied at 25 percent of its maximum stretchability on their dominant upper trapezius muscle. Participants performed five active shoulder repositioning tasks at 100° in both frontal and scapular planes. The measurements were repeated without iKT applied. Results: Generalized linear mixed effects model revealed a statistically significant main effect of iKT on scapular posterior tilt during arm abduction at 100° (p < 0.05). Tukey (HSD) pairwise comparisons showed a significant increase of scapular posterior tilt in the iKT condition compared to no-tape in the frontal plane (p < 0.05). Finally, no statistically significant main effects of the treatment, the plane of motion, nor factors interaction on shoulder repositioning absolute error nor the activity ratio of the lower trapezius as scapular stabilizer were observed. Conclusion: The results suggest that iKT modulated sensorimotor integration at the shoulder girdle reflected in a significant increase in posterior scapular tilt and showed a trend to increase both the activity ratio of the lower trapezius as a scapular stabilizer and shoulder repositioning absolute error during arm abduction at 100°. This finding may have clinical meaning since posterior tilting of the scapula increases the subacromial space increases, where a reduced subacromial space contributes to an increase in the risk of injury of the rotator cuff tendon during over-shoulder arm raising in the frontal plane.
Advances of high-order interactions in the human brain : applications in aging and neurodegeneration
(Universidad de Valparaíso, 2022) Gatica Briceño, Marilyn; Orio, Patricio (Advisor); Cortés, Jesús M. (Advisor)
The human brain generates a large repertoire of spatio-temporal patterns, which support a wide variety of motor, cognitive, and behavioral functions. The most accepted hypothesis in modern neuroscience is that each of these representations is encoded in different brain networks. From MRI, networks can be defined anatomically (“structural connectivity”-SC) or functionally (“functional connectivity”-FC). Interestingly, while SC is by definition pairwise (white matter fibers project from one region to another), FC is not. In this thesis we have focused on the study of high-order interactions (HOI) that occur in functional networks, beyond the existing statistical relationships in pairs of regions. When evaluating the interacting n-plets, from triplets to order n, a novel type of statistical interdependencies appear, namely the synergistic and redundant interactions, which are inaccessible when evaluating interacting pairs. The study of these HOI in the human brain in aging and neurodegeneration is the purpose of this thesis. Starting from the O-Information formalism, we have systematically analyzed synergistic and re- dundant interactions in functional networks of the human brain. In the first part of this thesis, we have applied this formalism to the aging brain and have found a higher preva- lence of redundant interdependences in older participants compared to younger ones, and this effect occurs in all orders of interaction within regions located in the prefrontal and motor areas, thus involving working memory, motor and executive functions. In the second part of the thesis, we have built a neurobiological-realistic computational model of the whole-brain that incorporates SC and FC data. Our model shows that, related to aging, variations in functional patterns can be explained by changes in SC, which neurodegenerate as we age. Based on this finding, we propose a simple nonlinear neurodegeneration model that is representative of healthy (non-pathological) aging and that reproduces the age variations that occur in the HOI structure of functional data. Finally, in the last part of this thesis, we have applied our formalism to a clinical population, and in particular to a cohort of older patients with Frontotemporal Dementia (FTD), comparing the redundant and synergistic patterns that occur in the HOI of these brains, in comparison with a control group of healthy population, well matched in age, sex and years of education with the FTD cohort. For this chapter, we have developed a new statistical tool that allows us to detect clusters that are significantly different between groups and where the interaction is predominantly synergistic or redundant. For our particular case of FTD, redundant triplets were found in higher-order vision networks, default mode, and salience network. Similarly, synergistic triplets were found in the primary auditory cortex. Together, the results obtained in this thesis pave an avenue of multiple possibilities in the study of HOI as informational markers in the high-order functionality of the brain, and how its alterations could reveal new organizational aspects of the human brain in health and disease.
Adversidad temprana y alteraciones neuropsiquiátricas en la edad adulta, mediante modificaciones neuroendocrinas y epigenéticas
(Universidad de Valparaíso, 2020) Espinosa González, Fernanda; Tutor: Moya Vera, Pablo
La adversidad temprana se ha considerado los últimos años como un gran problema de salud pública, ya sea en forma de negligencia, estados socioeconómicos, abuso, deprivación y maltrato, la cual se asocia con alteraciones de salud física y mental en etapas posteriores. Esto ya que se ha evidenciado que la exposición a adversidad temprana durante periodos considerados críticos como pre y postnatal, pueden causar alteraciones neuroendocrinas, como la desregulación del eje hipotálamo-hipofisiario-adrenal, alteración que persiste por periodos posteriores como la edad adulta. El que de manera clínica se manifiesta como alteraciones cognitivo/conductuales, alteraciones de aprendizaje y memoria, conductas depresivas y ansiosas, y patologías neuropsiquiátricas. Uno de los mecanismos que más relevancia a tomado los últimos años y que asocia la adversidad temprana con alteraciones neuropsicológicas en etapas posteriores, es la regulación génica mediante mecanismos epigenéticos. Genes como el NR3C1 que codifica para el receptor de glucocorticoides, el gen FKBP5 que codifica para una proteína reguladora de la respuesta al estrés, y el gen SLC6A4 que codifica para el transportador de serotonina. Este último menos estudiado en asociación con estrés, pero que ha evidenciado una asociación importante en la triada estrés, patologías neuropsiquiátricas y epigenética. Esta revisión se enfoca en estudios que asocian la adversidad temprana con mecanismos epigenéticos en etapas tempranas de la infancia, alteraciones neuropsiquiátricas en etapa adulta y reversión de la metilación en estudios humanos seleccionados según criterios de inclusión de esta revisión.
Aislamiento de bacterias biodegradadoras de hidrocarburos desde aguas empetroladas de la bahía de Quintero
(Universidad de Valparaíso, 2017) Jeria Cortés, Eduardo; Zahr Tajmuch, Marcela (Directora de tesis)
El petróleo es una importante fuente económica e industrial que presenta un alto grado de toxicidad para el medio ambiente. Diversos estudios se han realizado para poder controlar y eliminar los efectos adversos que produce el petróleo y sus derivados en el ambiente, en especial el uso de microorganismos o productos microbianos., tales como bioestimulación que consiste en establecer las condiciones necesarias para que las bacterias autóctonas se encarguen de la desintoxicación del ambiente, y bioaumentación, que consiste en el ingreso de bacterias nuevas a un ambiente con el fin de eliminar los componentes tóxicos. En este trabajo se realizó una evaluación del potencial de biodegradación de cepas aisladas de muestras de aguas empetroladas provenientes de la bahía de Quintero a través de su capacidad de crecimiento en medios sólidos en presencia de crudos de petróleo y derivados de hidrocarburos alifáticos como el hexadecano y aromáticos como el antraceno y el criseno. Se hizo una caracterización macroscópica y microscópica de las cepas además de su identificación bioquímica y molecular. Se caracterizaron morfológicamente 33 cepas de las cuales 14 cepas presentaron la capacidad de degradar hidrocarburos, equivalentes al 45% del total de cepas aisladas. Solo 5 fueron capaces de degradar los tres derivados utilizados (Hexadecano, antraceno y criseno). Adicionalmente se caracterizaron bioquímicamente las 14 cepas degradadoras de petróleo obteniéndose preliminarmente que corresponden a EMB5: Acromonas hydrophila, EMB7: Pseudomonas luteola, SDM1: Shewanella putrefaciens, SDM6: Cryseobacterium neningosepticum, SDM7: Senotrophomonas maltophila, SDM8: Aeromonas hydrophila, MZN1: Ochrobactrum anthropi, MZN4: Brevundimonas vesicularis, MZN5: Chryseobacterium indologenes, MZN6: Sphingomonas paucimobilis, MZ9: Photobacterium damselae, MZN14: Oligella ureolytica y MZN16: Sphingomonas paucimobilis. Por métodos moleculares se consiguió amplificación exitosa de las cepas SDM6 y MZN14, por lo que es necesario continuar probando con diferentes condiciones de PCR. Adicionalmente es necesario realizar pruebas adicionales, la determinación de las tasas de degradación de cada derivado de hidrocarburos y la determinación de interacciones antagónicas entre las cepas aisladas para su posible uso en biorremediacion.
Algunas clases de modelos con enlace asimétrico para datos de respuesta cualitativa dicotómica : propiedades y estimación
(Universidad de Valparaíso, 2022) Chocotea Poca, Omar; Ibacache P., Germán; Profesora Co-guía: Nicolis, Orietta
En este trabajo, primero revisamos las condiciones suficientes y necesarias para la propiedad de distribución posterior de una clase de modelos con enlace asimétrico para datos de respuesta cualitativa dicotómica. La clase de modelos permite modular las distribuciones involucradas, por ejemplo, se toma como caso particular el modelo con enlace probit-asimétrico. Tras el uso habitual del modelo con enlace probit-asimétrico para situaciones de datos de respuesta cualitativa dicotómica desbalanceada, surge la necesidad de un modelo que, además de tener un parámetro de forma, incluya otro parámetro que controle el peso de las colas del enlace, proporcionando un modelo más flexible, que es el que se presenta en este trabajo. Para evitar tener un estimador divergente del parámetro de forma con la estimación de máxima verosimilitud, se utiliza la estimación de máxima verosimilitud penalizada. La metodología se ilustra con tres estudios de simulación y datos reales. Por unanimidad, los resultados sugieren que el modelo más adecuado es el propuesto. Finalmente, proponemos una nueva clase de modelos con enlace de mezcla en la escala y forma de la normal-asimétrica. Se proporcionan distribuciones a posteriori completas para utilizar el muestreador de Gibbs en la estimación.
Algunos aspectos asociados a una singularidad silla-foco: el 1-ciclo de Silnikov
(Universidad de Valparaíso, 2011-01) Reyes Caroca, Ricardo; Stange Sturia, Eduardo
Alteración astroglial en epileptogénesis inducida por pentilentetrazol en hipocampo de ratón
(Universidad de Valparaíso, 2019) Díaz García, Franco; Bonansco Herrera, Christian (Director de tesis)
La epilepsia se caracteriza por la aparición recurrente de crisis espontáneas que se relacionan con hiperactividad cerebral y alteración en el balance excitación-inhibición. En modelos de epileptogénesis en ratas, como el kindling eléctrico, se han observado cambios en la transmisión sináptica glutamatérgica en hipocampo, puntualmente un aumento en la eficacia sináptica debido a la hiperexcitabilidad astroglial mediada por Ca2+ y astrogliosis. Sin embargo, hasta ahora se desconocen los cambios en la excitabilidad astroglial y cómo esta repercutiría en la transmisión sináptica glutamatérgica en el modelo de epilepsia inducida por pentilentetrazol (PTZ) aplicado en ratón. Para esto aplicamos un modelo de epileptogénesis inducida por PTZ en ratón. El protocolo consta en 7 dosis de 35 mg/kg i.p de PTZ administradas día por medio y posteriormente se procedió a realizar rebanadas de hipocampo. Evaluamos la transmisión sináptica excitatoria en el circuito CA3-CA1 mediante la técnica de registro extracelular de campo en rebanadas de hipocampo y la excitabilidad astroglial mediada por Ca2+ a través del registro de las ondas de Ca2+ en hipocampo. Paralelamente, se analizaron los cambios morfológicos, específicamente cambios de expresión de proteína acídica fibrilar glial (GFAP) y de expresión de receptores P2Y1 y mGluR5. Nuestros resultados indican que en el hipocampo de ratones kindleados con PTZ se produce: 1) aumento en la probabilidad de liberación en sinapsis de CA3-CA1, 2) aumento en la duración promedio de las oscilaciones espontáneas de Ca2+ astroglial, como consecuencia del aumento en la frecuencia y porcentaje de oscilaciones lentas (ST) y 3) aumento en los valores de área relativa a la tinción con GFAP junto a una sobre expresión de receptores P2Y1 y mGluR5. Estos resultados sugieren que, al igual que en otros modelo de kindling, cómo el eléctrico, la hiperexcitabilidad astroglial representa el mecanismo que produce el aumento en la gliotransmisión mediada por glutamato, provocando un alza en la probabilidad de liberación en terminales glutamatérgicos en el hipocampo epiléptico, aumentando la progresión de la epilepsia.
Alteraciones en la exocitosis en lineas celulares de pacientes portadores de disferlinopatía
(Universidad de Valparaíso, 2019) Almarza Salazar, Hugo; Cárdenas Díaz, Ana M. (Directora de tesis)
Disferlina es una proteína altamente expresada en la membrana plasmática de células musculares. Se ha demostrado que la principal función de esta proteína es la reparación de membranas, por lo que su rol es fundamental para el mantenimiento de la integridad muscular. Mutaciones en el gen que codifica para disferlina (DYSF) son causantes de disferlinopatías, una enfermedad muscular congénita que incluye la distrofia muscular tipo 2B (LGMD2B) la miopatía de Miyoshi (MM) y la Miopatia distal. Disferlina posee siete dominios C2 con afinidad variable a Ca2+ y a fosfolípidos, los que están implicados en procesos de fusión de membranas mediados por proteínas SNARE. Esto último, sumado a que el tráfico de proteínas hacia la membrana plasmática se ve afectado en mioblastos de ratones deficientes de disferlina hace plausible suponer que disferlina podría jugar un papel en la exocitosis-dependiente de Ca2+. En el presente trabajo se estudió el proceso de exocitosis en líneas celulares de mioblastos provenientes de pacientes portadores de mutaciones en disferlina. Para monitorear la exocitosis se transfectaron los mioblastos con la Aminopeptidasa Regulada por Insulina (IRAP) fusionada a la sonda pHluorina, una proteína fluorescente verde sensible a pH. IRAP es ampliamente utilizada como reportero del tráfico del transportador de glucosa GLUT4, una ruta clave para el funcionamiento y el metabolismo de las células musculares. El constructo IRAP-pHluorina sobre-expresado en las líneas musculares fue visualizado mediante microscopía de reflexión total interna de la flurescencia (TIRF) bajo distintas condiciones experimentales. Nuestros resultados muestran que la estimulación con el ionóforo de Ca2+ ionomicina promueve abundantes eventos de exocitosis en la línea celular C25, correspondientes a mioblastos provenientes de un individuo sano. Sin embargo, el número de eventos inducidos por ionomicina en los mioblastos 379, 107, AB320 y ER, provenientes de músculo esquelético de pacientes con disferlinopatía, fue significativamente menor sugiriendo que defectos en el tráfico y/o en la exocitosis de vesículas contenedoras de GLUT4 podría ser un mecanismo afectado en células musculares con mutaciones en el gen DYSF.
Análisis de la definición y propiedades de los logaritmos en un texto escolar basada en la metodología de análisis de Juan D. Godino
(Universidad de Valparaíso, 2013) Alcaíno Fernández, Cristian; Ortiz Rojas, Carolina; Gómez, Silvana
Se presenta el trabajo en donde se aplica una metodología de análisis a un proceso de instrucción matemática propuesto por un texto, con respecto a la definición y propiedades de los logaritmos según la metodología de Juan D. Godino, el trabajo comprenderá dos dimensiones: - Análisis epistémico (naturaleza y secuenciación de los componentes del conocimiento matemático en juego). - Análisis semiótico (proceso de interpretación y negociación de los significados). A través de estos análisis, se persigue poner en evidencia los potenciales conflictos en relación a la propuesta de instrucción de un texto utilizado enseñanza media, pues según los resultados publicados por el Demre1 muestran un problema en relación a algunas preguntas relacionadas con definición y propiedades de logaritmo.
Análisis de la potencia olfatoria de la fracción soluble en agua del petróleo crudo mediante registros de electroolfatograma en trucha arcoiris (oncorhynchus mykiss)
(Universidad de Valparaíso, 2017) Ponce López, Daniela; Schmachtenberg, Oliver (Tutor)
Los derrames de petróleo en ambientes acuáticos son muy dañinos para el ecosistema, ya que provocan la muerte de muchos organismos, generando contaminación. Los peces en general, pueden evitar la fracción de petróleo hidrófoba nadando a lugares sin contaminación, pero sólo si reciben la información sensorial adecuada. Este estudio pretende evaluar cómo la fracción soluble en agua del petróleo crudo (FSA-PC) puede ser detectada por la trucha arcoíris mediante el olfato, observar si la exposición inmediata, a corto y largo plazo (45 minutos y 24 horas) a la FSA-PC afecta la respuesta a odorantes ya estandarizados (L-Serina) y a través de cortes histológicos, observar si existe daño en el órgano olfatorio. Para esto se utilizó la técnica de electroolfatograma (EOG), para registrar la actividad eléctrica de un grupo de neuronas receptoras olfativas desde la mucosa olfatoria, y se estimuló con distintas diluciones de la FSA-PC, (1:10; 1:100; 1:103; 1:104 y 1:105), intercalando entre cada dilución de FSA-PC estímulos de L-Serina a 100 M. Hubo respuesta a todas las diluciones de FSA-PC lo que sugiere que la fracción soluble en agua del petróleo crudo es un olor para la trucha arcoíris. La respuesta de L-Serina a 100 M aumenta al estimular con las diluciones de FSA-PC más concentradas, indicando la existencia de algún mecanismo de potenciación y/o recuperación. Al estimular con L-Serina a 100 M después de las perfusiones no se observaron cambios significativos. En los cortes histológicos, se observó un leve engrosamiento del epitelio en la exposición de 24 horas. Se necesitan realizar estudios de tipo conductual para correlacionar los hallazgos observados en este estudio con la reacción de las truchas frente a la presencia de petróleo.
Análisis de sobrevivencia desde una perspectiva no paramétrica
(Universidad de Valparaíso, 2018-01) González Chaperón, Mayra; Henríquez Roldan, Carlos
Análisis del error en ecuaciones cuadráticas
(Universidad de Valparaíso, 2011-10) Velozo Boza, Gloria; Ávila Contreras, Jorge
El presente estudio pretende constatar, indagar y analizar las dificultades y errores de alumnos de tercer año medio, considerando un grupo de estudiantes, con los cuales interactuar para apreciar las dificultades que surgen al enfrentarse a las ecuaciones cuadráticas, enfocándonos en el ámbito procedimental y emocional, entendiendo el primero con todo lo relativo a las operatorias que surgen al resolver ecuaciones de este tipo con sus diferentes posibles métodos de resolución, mientras que el segundo ámbito alude a las emociones o actitudes que surgen en los estudiantes al momento de desarrollar las actividades propuestas para indagar en nuestro tema de estudio. Comprendiendo la diversidad de errores que surgen en las operatorias de resolución de ecuaciones cuadráticas, es que se delimita este estudio al análisis de errores y sus posibles dificultades en: ecuaciones cuadráticas equivalentes, cuando los coeficientes de la ecuación son números enteros y su equivalente con coeficientes fraccionarios, la generalización de la propiedad de sin divisores de cero a números distintos de cero y la resolución de problemas de planteo con ecuaciones cuadráticas, prestando atención en este último a la conversión de lenguaje natural al algebraico.
Análisis del tratamiento de la unidad "ecuaciones de primer grado" en el nivel NB6 en un curso de un liceo municipal de la V región
(Universidad de Valparaíso, 2011-12) Bahamondes Quiroz, Roxana; Codina Muñoz, David; Concha León, Néstor; Parraguez Rodríguez, Nicolás; López, Patricia
Análisis espacial y temporal del Covid-19 en Chile
(Universidad de Valparaíso, 2022-01-07) Escobar Rivera, Valentina Alejandra; Velandia, Daira
La pandemia llamada COVID-19 causada por el SARS-CoV-2 sigue amenazando la salud pública en todo el mundo, es por esto que comprender la dinámica espacial y temporal a nivel regional y comunal es muy importante en pro de comprender la propagación de la pandemia y de evaluar las medidas implementadas en el plan Paso a Paso. En el presente proyecto se explora la dinámica espacial y temporal del COVID-19 en Valparaíso, utilizando la variable casos diarios confirmados. Se evalúa la asociación espacial a través del índice de Morán (local y global), entre Junio 2020 y Junio 2021, señalando la presencia de un patrón espacial y temporal, dado que el índice de Morán en todas las semanas epidemiológicas consideradas, indicó un p-valor cercano a cero, además fue lo suficientemente alto para indicar dependencia espacial positiva.

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